A implementação do Portugal 2020 está organizada em quatro diferentes domínios:
- Competitividade e Internacionalização, implementado através do Programa COMPETE 2020;
- Inclusão Social e Emprego, executado através do Programa PO ISE;
- Capital Humano, através do Programa PO CH;
- Sustentabilidade e Eficiência no Uso de Recursos, implementado através do Programa PO SEUR.
